Abb. 1: Naegleria-fowleri-Kultur, Hämatoxylin-Färbung nach Heidenhain.
Die Amöbe (10 μm-30 μm) besitzt einen Limaxkern mit großem Kernkörperchen (Karyosom), umgeben von einem hellen Hof (Halo). Sie gehört zu den monopodialen Amöben und bildet breite abgerundete Scheinfüßchen (Lobopodien) in Bewegungsrichtung aus.